Fundada em 1968 por um grupo ativo de pediatras composto pelos Drs. Antonio Marcio Lisboa, Edson Porto, Eduardo Mariz, Ernesto Silva, Guinemer Otero, José Flores, Jorge Sotomayor e Marinice Midlej Joaquim, a SPDF comemora nesta ano cinquenta anos de existencia.
Teve como primeiro presidente eleito o Dr. Antonio Marcio Lisboa, personagem de gande destaque no desenvolvimento do ensino e pesquisa pediátrico no Distrito Federal.